Мы не продаем "кота в мешке"! Прежде, чем предложить товар нового поставщика Вам, мы сами тестируем его в лаборатории. Прочитайте отчет нашего специалиста о результатах апробации товаров компании BioDynami:
Набор для высокочувствительного измерения концентрации двуцепочечной ДНК,
dsDNA Quantification High Sensitivity Kit для флуориметра Qubit.
Была проведена серия сравнительных измерений образцов ДНК наборами трех разных производителей: Thermo Fisher Scientific, Lumiprobe, BioDynami. Измерения проводились на приборе Qubit 4. Образцы ДНК были различных концентраций от 0,5 до 60 нг/мкл. Для всех концентраций образцов значения совпали для всех наборов в пределах допустимой погрешности, кроме образцов с концентрацией выше 50 нг/мкл. Для данных образцов концентрации оказались непромеряемыми для всех наборов, так как данное значение выходит за рамки чувствительности наборов линий high sensitivity.
Sample | Thermo Fisher Scientific | Lumiprobe | BioDynami |
1 | 54 | 53 | too high |
2 | 51 | 54 | too high |
3 | 1,49 | 2,11 | 2,05 |
4 | 7,77 | 10,8 | 10,3 |
Набор для фрагментации и пробоподготовки библиотек ДНК с праймерами и реагентами ПЦР,
NGS DNA Fragmentation & Library Prep Kit (with non-index primers & PCR).
Было проведено сравнение набора BioDynami для фрагментации и пробоподготовки библиотек ДНК с набором KAPA Hyper plus (Roche). В протоколах были использованы одни и те же образцы ДНК. Образцы отличались по входной концентрации для данных наборов: на пределе допустимой минимальной, недостаточная, избыточная (2х кратное превышение). Были проведены реакции фрагментации, затупления концов, лигирование универсальных адаптеров, ПЦР с индекс-специфичечкими праймерами, серия отмывок на магнитных частицах. Для реактивов биодинами также была проведена серия экспериментов с индекс-праймерами от Roche. Контроль качества библиотек осуществлялся с помощью приборов Qubit 4 и Bioanalyzer Agilent 2100.
Выводы:
1) Протокол BioDynami быстрее и проще за счёт сокращения и оптимизации шагов по отмывке, а также отсутствия необходимости приготовления смесей ферментов и буферов. Меньше риск ошибок, удобнее проводить автоматизацию.
2) Фрагментационный модуль BioDynami стабильнее, менее чувствителен к концентрации и качеству входящего материала. Более широкий диапазон входного материала по качеству.
3) За счёт оптимизации и отсутствия высоких температур в монотермических реакциях набор BioDynami более удобен для автоматизации на станциях автоматической пробоподготовки.
4) Эксперимент не выявил разницу по качеству и концентрации библиотек с праймерами BioDynami и Roche (что в дальнейшем подтвердилось при сравнительном секвенировании полученных библиотек).
Протокол может успешно применяться с распространённым индекс-праймерами сторонних производителей.
BioDynami, индекс-адаптеры производителя.
BioDynami, индекс-адаптеры Roche.