Мы провели апробацию продуктов производства компании BioDynami.

Меню

Заказать звонок

С 9:00 до 20:00

г. Москва,109316,
Волгоградский проспект, д. 28A

Заказать звонок

Личный кабинет

0 0 0
Решения

Мы провели апробацию продуктов производства компании BioDynami.

Оформление заказа

Мы провели апробацию продуктов производства компании BioDynami.
Мы не продаем "кота в мешке"! Прежде чем предложить товар вам, мы тестируем его в нашей лаборатории.
26.02.2021

   Ознакомьтесь с отчетом нашего специалиста о результатах апробации товаров компании BioDynami:

Набор для высокочувствительного измерения концентрации двуцепочечной ДНК, 
dsDNA Quantification High Sensitivity Kit для флуориметра Qubit.

   Была проведена серия сравнительных измерений образцов ДНК наборами трех разных производителей: Thermo Fisher Scientific, Lumiprobe, BioDynami. Измерения проводились на приборе Qubit 4. Образцы ДНК были различных концентраций от 0,5 до 60 нг/мкл. Для всех концентраций образцов значения совпали для всех наборов в пределах допустимой погрешности, кроме образцов с концентрацией выше 50 нг/мкл. Для данных образцов концентрации оказались непромеряемыми для всех наборов, так как данное значение выходит за рамки чувствительности наборов линий high sensitivity.

Sample  Thermo Fisher Scientific   Lumiprobe   BioDynami 
1 54 53 too high
2 51 54 too high
3 1,49 2,11 2,05
4 7,77 10,8 10,3

Набор для фрагментации и пробоподготовки библиотек ДНК с праймерами и реагентами ПЦР, 
NGS DNA Fragmentation & Library Prep Kit (with non-index primers & PCR).

   Было проведено сравнение набора BioDynami для фрагментации и пробоподготовки библиотек ДНК с набором KAPA Hyper plus (Roche). В протоколах были использованы одни и те же образцы ДНК. Образцы отличались по входной концентрации для данных наборов: на пределе допустимой минимальной, недостаточная, избыточная (2х кратное превышение). Были проведены реакции фрагментации, затупления концов, лигирование универсальных адаптеров, ПЦР с индекс-специфичечкими праймерами, серия отмывок на магнитных частицах. Для реактивов биодинами также была проведена серия экспериментов с индекс-праймерами от Roche. Контроль качества библиотек осуществлялся с помощью приборов Qubit 4 и Bioanalyzer Agilent 2100.

Выводы:

1) Протокол BioDynami быстрее и проще за счёт сокращения и оптимизации шагов по отмывке, а также отсутствия необходимости приготовления смесей ферментов и буферов. Меньше риск ошибок, удобнее проводить автоматизацию.

2) Фрагментационный модуль BioDynami стабильнее, менее чувствителен к концентрации и качеству входящего материала. Более широкий диапазон входного материала по качеству.

3) За счёт оптимизации и отсутствия высоких температур в монотермических реакциях набор BioDynami более удобен для автоматизации на станциях автоматической пробоподготовки.

4) Эксперимент не выявил разницу по качеству и концентрации библиотек с праймерами BioDynami и Roche (что в дальнейшем подтвердилось при сравнительном секвенировании полученных библиотек).

   Протокол может успешно применяться с распространённым индекс-праймерами сторонних производителей.


BioDynami, индекс-адаптеры производителя.



BioDynami, индекс-адаптеры Roche.